这次的《宝可梦传说 阿尔宙斯》故事的发生场景是在神奥地区，而且是过去的深奥地区，在这里有天冠山以及很壮阔的自然景观。在这一次的作品中，能够见到以前的精灵球，这些精灵球是用木头做的，捕捉宝可梦的时候效果也很有特色。
《宝可梦传说：阿尔宙斯》神奥地区地图介绍：
《宝可梦传说 阿尔宙斯》的冒险舞台，是过去的神奥地区。
神奥地区是个颇具特色的地方，中央耸立着天冠山，并且拥有广阔的大自然，同时也是《宝可梦 钻石/珍珠(ポケットモンスター ダイヤモンド・パール)》的冒险舞台。
而这次的故事则是发生在很久以前的神奥地区，并且当时还没有宝可梦训练家和宝可梦联盟的概念。
在严苛的自然环境下，宝可梦以真实自然的状态在各种各样的地方生活，但它们会展现出与《宝可梦 钻石/珍珠》时代的神奥地区有所不同的生态系统。
过去的精灵球会使用很多木材制作，似乎与我们熟知的精灵球构造有些不同，比如在捉住宝可梦时它的上方会喷出蒸汽等等。
